Trabajando de manera integrada desde una plataforma matricial, la UICN- Mesoamérica pone en funcionamiento su programa de trabajo con el apoyo de cuatro unidades de trabajo:
- Unidad de Equidad Social
- Unidad de Gestión de Políticas Ambientales
- Unidad de Biodiversidad y Uso sostenible
- Unidad de Agua
Estas cuantro unidades se compactan para alcanzar un trabajo integral que incorpore las variables sociales, político-institucionales y ambientales que garanticen el mayor éxito posible en las iniciativas impulsadas por la Oficina Regional para Mesoamérica.
